Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms