Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpa1P57784 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpa1P57784 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms