Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms