Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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