Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms