Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5bP56480 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms