Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp5P56399 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms