Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp5g3P56384 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp5g3P56384 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp5g3P56384 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp5g3P56384 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp5g3P56384 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Atp5g3P56384 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atp5g3P56384 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms