Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcanP55066 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcanP55066 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcanP55066 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcanP55066 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcanP55066 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcanP55066 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcanP55066 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcanP55066 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NcanP55066 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NcanP55066 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NcanP55066 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NcanP55066 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms