Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms