Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad23aP54726 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms