Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacnb3P54285 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms