Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms