Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cux1P53564 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms