Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms