Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Matn1P51942 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Matn1P51942 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Matn1P51942 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms