Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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