Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc4P51655 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms