Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TubP50586 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TubP50586 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TubP50586 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TubP50586 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TubP50586 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TubP50586 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TubP50586 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TubP50586 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TubP50586 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TubP50586 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms