Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psen1P49769 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms