Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms