Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms