Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms