Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gbx2P48031 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx2P48031 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms