Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CratP47934 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CratP47934 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CratP47934 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CratP47934 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CratP47934 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CratP47934 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CratP47934 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms