Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gli1P47806 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gli1P47806 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms