Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms