Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms