Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms