Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms