Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mmp9P41245 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mmp9P41245 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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