Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CskP41241 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CskP41241 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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CskP41241 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CskP41241 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CskP41241 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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