Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbP41155 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbP41155 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbP41155 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms