Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rpl28P41105 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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