Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd1P40201 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd1P40201 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd1P40201 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms