Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgclP38060 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmgclP38060 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgclP38060 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HmgclP38060 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HmgclP38060 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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HmgclP38060 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HmgclP38060 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HmgclP38060 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HmgclP38060 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgclP38060 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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