Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprkP35822 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprkP35822 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
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