Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddit3P35639 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddit3P35639 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms