Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2aP35436 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms