Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sftpa1P35242 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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