Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms