Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp13P33435 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms