Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms