Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1P29341 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms