Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcdP28867 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms