Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprmP28828 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms