Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2afxP27661 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms