Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
U2af2P26369 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
U2af2P26369 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U2af2P26369 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms