Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna1P26231 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms