Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pou2f1P25425 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pou2f1P25425 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms